Durant des années, le conflit armé entre l'Armée de résistance du Seigneur et les forces gouvernementales, dans le nord de l’Ouganda, a contraint d’innombrables habitants à abandonner leur foyer pour se réfugier dans des camps pour personnes déplacées. À la suite de l'accord de cessation des hostilités signé en août 2006, un nombre croissant de déplacés internes sont retournés (ou sont en train de retourner) dans leur village d’origine. Désormais, les milliers d’autres personnes qui continuent de vivre dans des camps ont davantage accès aux terres arables.

Le CICR est présent en Ouganda depuis 1979. Dans le nord du pays, il apporte une assistance à quelque 500 000 personnes déplacées, et facilite leur retour dans leur région d’origine. Il s'attache notamment à renforcer la sécurité économique des populations qui restent vulnérables et soutient les efforts déployés par les autorités responsables de la santé et de l’approvisionnement en eau pour améliorer leurs services de base. En outre, le CICR maintient un contact étroit avec d’autres organisations humanitaires et de développement pour éviter tout chevauchement d’activités.

Dans l'ensemble du pays, notamment dans la région de Karamoja (dans le nord-est), le CICR poursuit le dialogue sur le respect de la population civile et des personnes privées de liberté avec les autorités pertinentes. Par ailleurs, il continue de renforcer la capacité de la Croix-Rouge de l’Ouganda à répondre aux besoins des personnes séparées par le conflit, en facilitant le rétablissement des liens familiaux dans tout le pays et dans les pays voisins. Il s’emploie également à promouvoir l’enseignement du droit international humanitaire au sein de la police et des forces armées, ainsi que dans les universités.

Présence (2009) : 260 collaborateurs, dont 27 expatriés.