Les populations autochtones sont exposées de manière disproportionnée au risque de déplacement. D'après les chiffres du Conseil norvégien pour les réfugiés (Norwegian Refugee Council) et de Human Rights Watch, les populations indigènes et afro-colombiennes représentent environ un quart de l'ensemble des personnes déplacées à l'intérieur de leur pays, alors qu'elles ne comptent que pour 11 % de la population globale du pays. Leur identité étant souvent intimement liée à leur territoire ancestral, la perte de leurs terres et de leurs moyens d'existence signifie aussi la perte de leur culture et de leur langue.